Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46DQ8NEK8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46DQ8NEK8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms