Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF148Q8N7C7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms