Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CLIP4Q8N3C7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLIP4Q8N3C7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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