Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC1Q7Z7K0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC1Q7Z7K0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC1Q7Z7K0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC1Q7Z7K0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms