Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ZNF550Q7Z398 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms