Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC80Q76M96 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms