Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RFPL4BQ6ZWI9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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RFPL4BQ6ZWI9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RFPL4BQ6ZWI9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RFPL4BQ6ZWI9 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RFPL4BQ6ZWI9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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