Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DENND5BQ6ZUT9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms