Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGSNQ5TDP6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms