Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms