Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
SDK2Q58EX2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms