Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCDC93Q567U6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms