Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BOLA3Q53S33 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms