Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC38Q502W7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms