Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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