Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms