Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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