Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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