Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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