Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGCBQ16585 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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