Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC85BQ15834 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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