Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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ALX1Q15699 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALX1Q15699 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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