Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCM1Q15154 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms