Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB3GAP1Q15042 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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