Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
R3HDM1Q15032 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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