Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms