Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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