Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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COL4A6Q14031 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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