Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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