Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX6Q13608 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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