Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2Q13563 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
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