Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLAMF1Q13291 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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