Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NR1H3Q13133 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms