Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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PRKAA1Q13131 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKAA1Q13131 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKAA1Q13131 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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