Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms