Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PTP4A2Q12974 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTP4A2Q12974 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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