Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EFEMP1Q12805 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms