Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TWF1Q12792 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TWF1Q12792 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1589.1 ms