Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC173Q0VFZ6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms