Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms