Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSME1Q06323 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms