Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTDSPL2Q05D32 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms