Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CD164Q04900 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CD164Q04900 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CD164Q04900 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms