Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NRG1Q02297 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NRG1Q02297 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms