Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH6A1Q02252 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH6A1Q02252 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms