Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CENPEQ02224 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms