Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC42EP1Q00587 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC42EP1Q00587 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms