Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms