Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDKL1Q00532 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms