Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXC5Q00444 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms